Terapija z udarnimi valovi ima lahko določene stranske učinke. Terapija z udarnimi valovi običajno uporablja močne zračne valove za doseganje terapevtskih učinkov. Med postopkom zdravljenja lahko povzroči poškodbo ledvic, sekundarne ureteralne kamne in dilatacijo sečnice. Nekateri bolniki lahko občutijo tudi lokalno rdečino tkiva, podkožne krvavitve, podplutbe, bolečino in druge simptome. Toda velika večina primerov je prehodnih in se bo postopoma izboljšalo po 1-2 dneh zdravljenja. Priporočljivo je, da bolniki ne skrbijo preveč, upoštevajo navodila zdravnika, se pravočasno zdravijo in nadzorujejo svoje stanje.